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复合碳源由多种复合糖的不完全酸水解或不完全酶水解制成。有效COD含量高，易被微生物吸收，可缩短驯化时间，节约成本。复合碳源可以缩短驯化时间，缩短停滞期，快速适应新环境，具有较高的生物利用度，促进反硝化和反硝化异养的快速繁殖。节省50%的碳源用量，复合碳源有效COD含量高。专为反硝化。复合碳源其性价比通常优于传统碳源，如甲醇、乙醇、淀粉、葡萄糖、乙酸和醋酸钠。碳源成本降低40%，、无害、生物友好
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复合碳源是指从大气中分离出来的有机物，包括石油、煤、天然气和生物质等。在工业生产过程中使用的碳源主要有三类：一是化石燃料，即石油及其制品；二是植物性燃料，如木炭、秸秆及甘蔗渣；三是合成原料。其中前两类属于不可再生能源，而合成材料所用的碳源主要是由石化产品或化工产品提供的。因此本文主要讨论可再生资源中的碳源。可再生资源中的碳源可分为有机物质和无机物两大类。前者包括动植物组织、微生物以及某些天然高分子化合物（如淀粉）。后者主要包括金属氧化物（如二氧化锰）、非金属材料以及硅酸盐类物质等。
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复合碳源，主要成为C和H，可被微生物全部降解，在污水处理的厌氧缺氧段，容易进入微生物体内，作为反硝化过程中的电子供体，容易被微生物吸收利用，促使硝态氮转化为氮气，实现脱氮。产品COD当量高，有限减少储运费用，闪点高，不存在使用风险，易溶于水，便于微生物吸收利用。 碳源的B/C转化率也是影响使用效果的重要指标，复合碳源的转化率较高为0.8，乙酸钠0.67，甲醇0.76，葡萄糖0.62，较高的转化率意味着相同的COD当量反硝化效率更高。